Skip to Main Content

Projekty badawcze w sieci VIA CARPATIA

Szczegóły projektu badawczego

Numer umowy
KS.zb.802.6.2021
Wykonawcy badań
RC/ WYDZIAŁ CHEMICZNY/ Rektor PRz
Tytuł
Selekcja genomowa pszenicy zwyczajnej
Streszczenie
Rozwój technologii sekwencjonowania DNA silnie ukształtował obecny panel metod genotypowania polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP) na poziomie skanowania całego genomu i wysokoprzepustowych testów pojedynczego locus. Obecnie sekwencjonowanie następnej generacji (NGS) jest często wykorzystywane do wykrywania SNP. Wykorzystanie wydajnego systemu selekcji genomowej pszenicy jest problemem ważnym gospodarczo i może pozwolić na poprawę wartości genetycznej odmian. Jakkolwiek obecność sekwencji powtarzalnych (pow. 80%) ogranicza liczbę unikalnych SNP. W celu eliminacji sekwencji powtarzalnych i redukcji złożoności stosuje się enzymy wrażliwe na metylację lub selekcję wybranej frakcji złożonego genomu na kulkach magnetycznych. Najnowsze rozwiązania obejmują wykorzystanie systemu CRISPR/Cas9 do wzbogacania bibliotek o sekwencje docelowe. […]
Program
dotacja na pokrycie kosztów badań podstawowych na rzecz postępu biologicznego w produkcji roślinnej w 2021 r.
Rezultat badań
Przewidywanie wartości genetycznej. Izolacja DNA i charakterystyka 500 linii markerami DArT. Ocena fenotypowa 186 rodów pszenicy zwyczajnej (zestaw do mapowania asocjacyjnego) w doświadczeniu polowym (1 rok) Optymalizacja konstrukcji bibliotek do NGS i charakterystyka epigenetyczna wybranego genotypu metodą PacBio lub ONT Konwersja wybranych 20 markerów na system bazujący na PCR (HRM, KASP lub STS)
Możliwość zastosowania rezultatów
Wyniki stanowią podstawę do opracowania modelu selekcji genomowej pszenicy zwyczajnej.
Uczelnia
Politechnika Rzeszowska

Informacje o projekcie

Stopka
Minister Nauki

Zadanie finansowane w ramach zlecenia
Ministra Nauki pod nazwą "Politechniczna Sieć VIA CARPATIA im. Prezydenta RP Lecha Kaczyńskiego" w latach 2022-2025

MNiSW
Wersja: 0.1b Właścicielem i administratorem danych zawartych w bazie danych są uczelnie: Politechnika Rzeszowska, Politechnika Lubelska oraz Politechnika Białostocka. Zaprojektowanie witryny: Paweł Kuraś, Krzysztof Demidowski, Veronika Vanivska
Built with using Oracle APEX